Börries

Prof. Dr. Dr.
Melanie Börries

Department für Biometrie, Epidemiologie und

Medizinische Bioinformatik
Institut für Medizinische Bioinformatik und Systemmedizin

Leitung
Tel.: 0761/270-84671
melanie.boerries@uniklinik-freiburg.de
https://www.uniklinik-freiburg.de/bembi

Vita

• 2001-2005 MD/PhD Stipendiat Dr. phil. Universität Basel, Schweiz und Dr. med, Medizinische Universität zu Lübeck
• 2005-2009 Postdoktorandin Institut für Experimentelle und Klinische Pharmakologie und Toxikologie, Universität Freiburg
• 2009-2012 Projektleiterin am Freiburg Institute for Advanced Studies (FRIAS) Universität Freiburg
• Seit 2013 Gruppenleiterin Deutsches Konsortium für Translationale Krebsforschung (DKTK)
• Seit 2019 W 3 Professorin für Medizinische Bioinformatik und Leitung des Instituts für Medizinische Bioinformatik und Systemmedizin, Universitätsklinikum Freiburg

Schwerpunkte Forschung

• Big Data/Multi-Omics Datenanalyse; Identifizierung von Krankheits-Biomarkern und möglichen Therapieoptionen mit Hilfe von Machine Learning Methoden
• Pipeline-Entwicklung für Hochdurchsatzdaten für die klinische Forschung und klinische Anwendung
• Analyse von Sequenzierungsdaten für Molekulare Tumorboards und im Konsortium MIRACUM
• Strategien der innovativen Versorgung für Patienten

Ausgewählte Publikationen

• Chakraborty S, Andrieux G, Hasan AMM, Ahmed M, Hosen MI, Rahman T, Hossain MA, Boerries M. Harnessing the tissue and plasma lncRNA-peptidome to discover peptide-based cancer biomarkers. Sci Rep. 2019 Aug 23;9(1):12322
• Mastroianni J, Stickel N, Andrlová H, Hanke K, Melchinger W, Duquesne S, Schmidt D, Falk M, Andrieux G, Pfeifer D, Dierbach H, Schmitt-Graeff A, Meiss F, Boerries M, Zeiser R. miR-146a controls immune response in the melanoma microenvironment. Cancer Res. 2019 Jan 1;79(1):183-195
• Hoefflin, R.,Geißler, A.-L., Fritsch, R., Claus, R.,,Wehrle, J., Metzger, P., Reiser, M., Mehmed, L., Fauth, L., Heiland, D.H., Erbes, T., Stock, F.,,Csanadi, A., Miething, C., Weddeling, B., Meiss, F., von Bubnoff, D., Dierks, C., Ge, I., Brass, V., Heeg, S., Schäfer, H., Boeker, M., Rawluk, J., Botzenhart, E.M., Kayser, G., Hettmer, S., Busch, H., Peters, C., Werner, M., Duyster, J., Brummer, T., Boerries, M., Lassmann, S. and von Bubnoff, N. (2018). Personalized clinical decision making through implementation of a Molecular Tumorboard – a German single centre experience. JCO Precision Oncology
• Klett H, Fuellgraf H, Levit-Zerdoun E, Hussung S, Kowar S, Küsters S, Bronsert P, Werner M, Wittel U, Fritsch R, Busch H, Boerries M. Identification and Validation of a Diagnostic and Prognostic Multi-Gene Biomarker Panel for Pancreatic Ductal Adenocarcinoma. Front Genet. 2018 Apr 5;9:108
• Mathew NR, Baumgartner F, Braun L,  Halbach S, Brummer T, Andrieux G, Börries M, Blazar BR, Zeiser R. Erratum: Sorafenib promotes graft-versus-leukemia activity in mice and humans through IL-15 production in FLT3-ITD-mutant leukemia cells. Nat Med. 2018 Mar;24(3):282-291

Spezielle Forschungsmethoden

• Entwicklung und Anwendung von standardisierten Workflows zur Analyse von Omics-Daten 
• Hochleistungs-Computer-Cluster

• Single Cell Analysis (10x Genomics)